Фильм «Doom: Аннигиляция» — это прямой сиквел к культовой экранизации игры 2005 года, возвращающий зрителей в мрачную и кровавую вселенную franchise. Действие разворачивается на спутнике Марса Фобосе, где секретная исследовательская база корпорации Union Aerospace Corporation вела опасные опыты с межпространственными порталами.
Колония строгого режима «Спроул» превратилась в законченный ад, где власть полностью перешла к заключённым. Деспотичная корпорация «Вейленд Интернэшнл», ранее диктовавшая правила, утратила контроль над этим клочком земли. Фактическим хозяином стал местный король — загадочный и беспощадный Франкенштейн, чьё правление подкрепляется беспощадными «Смертельными гонками», где победа равна выживанию.