Фильм переносит зрителя в бурное время 1580 года, когда Европу раздирают религиозные конфликты и свирепствует чума. Главный герой, осиротевший юноша Бальтазар Кобер, оказывается на попечении загадочного учителя, погружённого в тайны кабалистики и алхимии. Это обучение становится отправной точкой для его необыкновенного путешествия.
Фильм «Знахарь» — это глубоко человечная драма о падении и возрождении, снятая по роману Тадеуша Доленги-Мостовича. Гениальный варшавский хирург Рафал Вильчур в один день теряет жену, дочь, работу, документы и имущество, оказавшись на улице без гроша. Годы скитаний и отчаяния меняют его до неузнаваемости, пока случай не приводит его в глухую деревню, в семью мельника.