Фильм переносит зрителя в атмосферу аргентинской тюрьмы начала 1980-х, где свирепствует военная диктатура. В одной камере оказываются двое заключённых, абсолютно разных по мировоззрению и судьбам: радикальный революционер Валентин Арреги, подвергающийся пыткам, и изящный гомосексуал Луис Молина, отбывающий срок за совращение несовершеннолетнего.
«Колония Дигнидад» — это хладнокровная драма, воссоздающая одну из самых мрачных глав послевоенной истории. Действие разворачивается в 1970-х, когда в Чили под прикрытием благотворительной коммуны существует настоящий нацистский гетто. Главный антагонист — Пауль Шефер, бывший офицер вермахта, создавший тоталитарную секту, где приверженцы живут в страхе, а newcomers становятся рабами и подопытными.