В небольшом городке жизнь подростка Элая меняется в один миг: его отстраняют от занятий в школе, а в семье накапливается напряжение из-за возвращения родного сына отчима, только что вышедшего из тюрьмы. Казалось бы, обычные семейные неурядицы, но всё кардинально меняется, когда Элай находит в заброшенном доме странный артефакт — нечто, что явно не земного происхождения.
Фильм «Люди Икс: Апокалипсис» продолжает переосмысленную киносагу о команде супергероев, действие которой переносится в 1980-е годы. Мир, только что переживший кризис из-за событий предыдущей картины, становится ареной для появления древнего мутанта Апокалипсиса, пробудившегося после тысячелетнего сна.