Фильм «Одни в Берлине» переносит зрителя в сердце нацистской столицы 1940 года, где под грузом повседневной страхи и пропаганды живут обычные люди. История основана на реальных событиях из жизни супругов Отто и Анны Квангель, которые после известия о гибели единственного сына на войне приходят к тихому, но решительному протесту.
Фло — тихий и застенчивый пятнадцатилетний, живущий в собственном мире, где даже мысль о сексе вызывает у него ступор. В то время как сверстники шутят о девушках и отношениях, он чувствует себя полным outsider'ом. Но однажды утром его привычная реальность рушится: его «лучший друг», который 15 лет пребывал в забвении, внезапно оживает и заявляет о своих правах.