В конце девяностых Япония потрясена чудовищной волной самоубийств, объединённых жутким ритуалом — все жертвы прыгают с одной и той же точки, башни Фудзё. За этим явлением стоит нечто большее, чем просто серия трагедий, и за расследование берётся Сики Рёги, обладающая редкой способностью «видеть линии смерти» и практикующий боевые искусства.
В альтернативной реальности конца XX века британская организация «Хеллсинг», существующая уже более ста лет, ведёт тайную войну против сверхъестественных угроз. Её главой стала сэр Интегра Хеллсинг, унаследовавшая дело отца и получившая в подчинение могучего вампира Алукарда, заключённого клятвой служить семье Хеллсинг.
Из засекреченной исследовательской лаборатории сбегает существо по имени Люси — генетически модифицированная девочка, чьи нечеловеческие способности и ярость оставляют за собой след из смертей. Однако на волю она выходит уже сильно травмированной: пуля в голову лишает её прошлого, речи и собственного «я».
1864 год, Киото. Япония стоит на пороге грандиозных перемен, и последний сёгунат Токугава пытается удержать власть. В этот переломный момент юный Тэцуносукэ Итимура, потерявший родителей, вместе с братом вступает в элитный самурайский полк Синсэнгуми, созданный для защиты порядка и интересов сёгуна. Его цель проста и жестокока — отточить навыки мечника, чтобы однажды отомстить.